MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-1

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000948	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000948	AGG	2	6	3356	3361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000948	TAAA	2	8	3362	3369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000948	AAG	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000948	T	6	6	3501	3506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000948	ATC	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_000948	TGG	2	6	3647	3652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000948	CTA	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_000948	AAT	2	6	3726	3731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000948	TAA	2	6	3791	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000948	TTTA	2	8	3889	3896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000948	TAA	2	6	3939	3944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000948	GGA	2	6	3951	3956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000948	G	6	6	7816	7821	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000948	TA	3	6	15167	15172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000948	TAAAAA	2	12	15182	15193	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000948	CAA	2	6	16497	16502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_000948	AAT	3	9	17078	17086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000948	TC	3	6	17123	17128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_000948	ATTTT	2	10	17181	17190	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000948	AAGGA	2	10	17215	17224	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000948	TTAT	2	8	18745	18752	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000948	TA	3	6	18762	18767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000948	T	6	6	18789	18794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000948	A	6	6	18797	18802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000948	A	7	7	18809	18815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000948	TAT	2	6	18836	18841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000948	CTA	2	6	18842	18847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_000948	T	7	7	18876	18882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000948	TGTAG	2	10	18936	18945	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000948	TTAAA	2	10	18953	18962	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000948	TAA	2	6	19015	19020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000948	T	7	7	19034	19040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000948	TAA	2	6	19078	19083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000948	ATT	2	6	19087	19092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000948	A	6	6	19107	19112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000948	T	7	7	21530	21536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000948	T	6	6	22784	22789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000948	TAT	2	6	22799	22804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000948	TAAA	2	8	22828	22835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000948	TTTTA	2	10	22853	22862	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000948	TAAGC	2	10	22934	22943	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_000948	TTA	2	6	22952	22957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000948	TAA	2	6	22978	22983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000948	TATT	2	8	22990	22997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000948	ATA	2	6	22998	23003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000948	ATATGT	2	12	23044	23055	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000948	A	7	7	23062	23068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000948	A	7	7	23081	23087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000948	T	7	7	23144	23150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000948	T	6	6	23157	23162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000948	A	6	6	23165	23170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000948	TA	3	6	23192	23197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000948	A	6	6	24568	24573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000948	A	7	7	24576	24582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000948	AGG	2	6	24595	24600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000948	ATTA	2	8	24601	24608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000948	AAGTAA	2	12	25851	25862	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000948	AAGA	2	8	26005	26012	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000948	AT	3	6	26029	26034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000948	AATTT	2	10	26049	26058	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000948	AGT	2	6	26086	26091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000948	GA	3	6	26104	26109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000948	GTT	2	6	26119	26124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000948	TA	3	6	26176	26181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000948	TAT	2	6	26206	26211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000948	GA	3	6	26784	26789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000948	AAC	2	6	27967	27972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_000948	A	7	7	27977	27983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000948	GTT	2	6	27990	27995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000948	T	7	7	27997	28003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000948	A	6	6	28056	28061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000948	TTTA	2	8	28089	28096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000948	TA	3	6	28095	28100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000948	CT	3	6	28101	28106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_000948	AGC	2	6	28696	28701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_000948	AAG	2	6	28746	28751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.